Sin embargo, las andanzas de este equipo se cortaron de golpe en 1936, año en el que estalló la Guerra civil española, hecho que obligó a suspender la liga durante tres temporadas. Al equipo le fue otorgado el «Premio al Juego Limpio». En agosto de 1952 se jugó por primera vez un encuentro con césped, siendo en un amistoso ante el Atlético de Madrid, mientras que en julio de 1954, una vez ya instalado el alumbrado, se empezaron a disputar partidos nocturnos.